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2023年06期 基于网络药理学和分子对接探讨山药治疗胃癌的作用机制

编辑: 发布时间:2024-01-18 点击:

张靓;唐芳婷;王红;唐萍;王若璇;李跃军;

目的 基于网络药理学和分子对接探讨山药治疗胃癌的潜在靶点及作用机制。方法 通过网络公开数据库筛选出山药的有效成分和潜在靶点及胃癌的相关基因,并绘制二者的交集基因,在Cytoscape 3.8.0中完成山药有效成分-靶点-胃癌的可视化分析,运用药物与疾病的交集基因构建蛋白质-蛋白质互作网络图(protein-protein interaction, PPI),并采用拓扑分析得到核心靶点,使用Rx64 4.1.2进行基因本体(gene ontology, GO)生物学过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析,利用AutoDock 1.5.7软件和PyMOL软件完成中药成分和疾病靶点间的分子对接。结果 共筛选出山药的有效成分12个及潜在靶点119个,与胃癌的共同靶点56个。拓扑分析筛选出TP53、HSP90AA1、AKT1可能为山药治疗胃癌的关键靶点。GO富集分析一共得到1 417个条目,KEGG富集分析共筛选出112条通路。分子对接结果显示AKT1与豆甾醇结合活性最强。结论 初步揭示了山药通过多项成分、多个靶点及多条通路发挥对抗胃癌的作用,其药物成分和靶点可有效结合。

2023年06期 v.20;No.94 108-116页 [查看摘要][在线阅读][下载 675K]

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